- Codice Arundel, 148v. – Studi sul corso dell’Arno e del Mugnone con appunti di matematica e lista della spesa, 1504.
- Codice sul volo degli uccelli, 18v. – Foglio con studio idrografico presso Firenze, note di vita quotidiana e prima formulazione della profezia del volo da Monte Ceceri: “1505 martedì sera addì 14 d’aprile venne Lorenzo a stare con meco disse essere d’età d’anni 17. E addì 15 del detto aprile ebbi fiorini 25 d’oro dal camarlingo di sancta Maria Nova. Del monte che tiene il nome del grande uccello piglierà il volo il famoso uccello ch’empierà il mondo di sua gran fama”, c. 1505.
- Codice di Madrid II, 22v-23r. – Studi per la deviazione dell’Arno, c. 1503-1504.
- Codice di Madrid II, 9r. – Fortificazioni di Piombino, con la torre e il fosso, nuovi bastioni, tunnel di collegamento con il rivellino della porta, c. 1503-1504.
- Codice Leicester, 16v. – Pagina con otto disegni e diciannove osservazioni («casi 18») sul corso dei fiumi e sulle tipologie di «obbietti»
- Codice Leicester, 8v. – Pagina senza illustrazioni, con osservazioni di geologia, paleontologia e geografia fisica, preceduta da un titolo: «Del Diluvio e dei nichi marini»
- Codice Atlantico, 865 r. – Studi e schizzi progettuali di architetture medicee in Firenze: “San Marco – (Palazzo di) Cosimo – (San) Giovannino”, c. 1515.
- Codice Atlantico, 256r. – Foglio con studi di un sistema di canali e citazione: “Bisenzio e l’Ombrone attraverseranno il Canale…”, c. 1513.
- Codice Atlantico, 225r. – Tra falcate e operazioni aritmetiche Leonardo menziona Alessandro Amadori, “canonico di Fiesole” e il “pian di Pisa”, c. 1515.
- Codice Arundel, 147r. – Studi sul corso dell’Arno e scritta apocrifa di Simone di Matteo Migliorotti, c. 1504.
- Codice Arundel, 132v. – Promemoria “El Vespucc[i]o mi vol dare il libro di gieometria”, c. 1503.
- Codice Arundel, 29v. – “Sasso saldo di Mugnone cavato for de dall’acqua in forma di vasi, pare opera manuale tanto è a punto”, c. 1506.
- Codice Arundel, 1r. – “Chominciato in Firenze in casa di Piero di Braccio Martelli addì 22 di marzo 1508”, 1508
- Codice Ashburnham 2037, 5v. – “Qui non si può né si debbe fare campanile, anzi debbe stare separato come ha il d[u]omo e’ San Giovanni di Firenze, e così il d[u]omo di Pisa, che mostra il campanile per sé dispiccato in circo, e così il d[u]omo”, c. 1487.














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